ذكر تقرير التقييم النهائي للخطة التشغيلية للهيئة العليا للأدوية والمستلزمات الطبية للعام 2009 أن الهيئة قد شاركت في إتلاف ستة مليون قرص كبتاجون والتخلص منه بإضافته في حمض الهيدروكليك المخفف ومن ثم تفريغه وطمره في حفر ودفنها كما تم إتلاف 4 طن من الحشيش مختلف الأنواع وذلك بحرقها ودفن مخلفاتها  بمكتب النائب العام وجهات أمنية ودبلوماسية وتم حجز 5 طن من الأدوية في مطار صنعاء الدولي منتظرة الإتلاف كما تم حجز 1،048 طرد في صالة المطار وتم ضبط 253 أدوية واصلة مع المسافرين واعتبارها أدوية مهربة.
فيما قام فرع الهيئة خلال العام المنصرم بضبط 15 كرتون منشطات جنسية مختلفة الأنواع في ميناء عدن و200,000قرص كبتاجون في ميناء المعلا و2,620,020قرص في ميناء الحاويات و29 صنف ادوية واصلة مع المسافرين في مطار عدن فيما تم ضبط 72 صنف دوائي مهرب ومقلد ومنتهية عن طريق فرع الحديدة وتم اتخاذ الإجراءات القانونية ضد أصحابها .
كما قامت الهيئة بضبط ومصادرة مجموعة من الأدوية المهربة والمزورة من 60 صيدلية بالتنسيق مع الإدارة العامة للخدمات الصيدلانية بالوزارة وتم مصادرة 110 باكت حكومي من مانع الحمل ميكروجينون  وأحيلت القضية للشئون القانونية لاتخاذ الإجراءات القانونية حيالها وإتلاف كمية الماء المقطر الموردة إلى هيئة مستشفى الثورة العام بسبب عدم مطابقتها للمواصفات ولاحتوائها على مولدات الحرارة وإتلاف 15 طن  من الأدوية المهربة والمنتهية والمزورة عن طريق مكتب الشؤون الصحية بمحافظة البيضاء.
وقامت اللجان المكلفة بالنزول الميداني والتفتيش على مصانع إنتاج الأدوية المحلية وعددها 9 مصانع و3 معامل إنتاج مطهرات خلال العام المنصرم للتحقق من مطابقتها لشروط التصنيع الجيد للأدوية وإبداء الملاحظات الفنية وإبلاغها إلى المعنيين فيها للعمل ولوحظ التزام معظم المصانع بإصلاح الملاحظات المرفوعة من قبل المفتشين وتحسين الأداء من خلال تأهيل الكادر
كما قامت الهيئة بحسب التقرير بإعداد قائمة خاصة بالأصناف الأكثر تزويرا وتهريبا لتعميمها ونشرها على مختلف المنشات الصيدلية والطبية للقضاء على ظاهرة الادوية المهربة والمزورة او الحد منها.